Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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