Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRAP18433 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms