Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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