Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HDAC6Q9UBN7 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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