Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms