Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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