Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FXNQ16595 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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