Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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VPS72Q15906 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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VPS72Q15906 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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VPS72Q15906 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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VPS72Q15906 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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