Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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CHD4Q14839 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHD4Q14839 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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