Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PRPF4BQ13523 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PRPF4BQ13523 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PRPF4BQ13523 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PRPF4BQ13523 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PRPF4BQ13523 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PRPF4BQ13523 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRPF4BQ13523 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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