Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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