Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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