Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms