Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMPOP42166 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms