Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRBP23467 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms