Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms