Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC38Q502W7 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC38Q502W7 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC38Q502W7 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC38Q502W7 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CCDC38Q502W7 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCDC38Q502W7 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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