Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VPS72Q15906 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms