Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms