Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDCD1Q15116 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDCD1Q15116 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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