Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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