Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
DUSP4Q13115 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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