Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GPS1Q13098 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GPS1Q13098 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms