Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TMPOP42166 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMPOP42166 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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