Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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HOXD10P28358 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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HOXD10P28358 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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HOXD10P28358 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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