Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRGP23470 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms