Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SNPHO15079 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SNPHO15079 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SNPHO15079 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SNPHO15079 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SNPHO15079 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SNPHO15079 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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