Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SWAP70Q9UH65 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWAP70Q9UH65 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms