Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL1Q9NSC2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL1Q9NSC2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms