Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms