Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce3Q9CPR8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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