Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn34b3Q80ZS5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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