Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Paxip1Q6NZQ4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Paxip1Q6NZQ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms