Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema3cQ62181 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms