Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm27235Q3UW50 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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