Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP20-2Q3LI61 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP20-2Q3LI61 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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