Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms