Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERCC6Q03468 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms