Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm2P58774 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms