Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GemP55041 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GemP55041 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GemP55041 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GemP55041 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GemP55041 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GemP55041 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms