Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms