Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Casp8O89110 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casp8O89110 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms