Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPATO15228 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GNPATO15228 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GNPATO15228 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GNPATO15228 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPATO15228 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPATO15228 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPATO15228 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms