Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IfnabL7MTU6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms