Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh8D3Z6W3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms