Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms