Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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