Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
UBXN4Q92575 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms