Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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CCDC142Q17RM4 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC142Q17RM4 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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