Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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